元妃萧耨斤虽然生下皇子，但是皇后萧菩萨哥天生貌美多才，平日里对承天太后又非常恭敬孝顺，所以依旧深得承天太后和圣宗皇帝的宠爱。这一切让元妃萧耨斤又妒又恨。那么野心勃勃的萧耨斤会用什么卑鄙手段来对付皇后萧菩萨哥呢？

元妃萧耨斤看在眼里，恼在心头，你有什么了不起？你连孩子都生不出来，就会弄点儿奇技淫巧，媚惑圣心。所以我得想办法把你弄死，我好当皇后。

皇后多才，才女就难免有点儿酸文假醋，皇后爱听曲，甚至自己有时作诗作词，让乐工谱成曲，所以她跟两个乐工就接触比较多。于是元妃就密告圣宗，说皇后跟这两个乐工有暧昧关系。但是圣宗根本就不信，置之一笑，说你就是羡慕嫉妒恨，以后不要跟朕讲这些了，我根本就不信。元妃处心积虑地要害皇后，甚至把匿名信扔到圣宗的龙床上，圣宗打开一看，说此必元妃所为，点把火给烧了，根本都不告诉皇后。

皇后对此事也很大度，因为她的地位是不可撼动的。你来这套就是因为你失败了，我作为胜利者我很大度。所以，皇后不拿她当回事。而且在承天萧太后死后，皇后也开始学习自己的姑母兼婆母兼舅母，把揽朝政，自置官署，把自己的生日定为顺天节，皇后一族势力是很大的，因为她的兄弟都是宰相。

皇后的势力大，元妃也在培养自己的势力，她的兄弟们也都入朝做官，后党跟妃党早晚有一天要火并。这一天很快就到来了，圣宗皇帝在位的第四十九个年头上病入膏肓，眼看就要归天了。皇帝还没死的时候，元妃就当着圣宗的面恶毒地咒骂皇后：“老物宠亦有既耶！”（《辽史后妃传圣宗仁德皇后萧氏》）你老东西受宠的日子已经没有了。圣宗还没咽气呢，元妃就当着圣宗的面这样骂皇后，所以圣宗很为皇后的将来担忧。确实皇后是仗着我宠着，我要是归了天，皇后宅心仁厚，斗不过元妃萧耨斤，可怎么办呢？圣宗就把太子，也就是皇后抚养大的耶律宗真叫到床边，跟耶律宗真讲：“皇后事我四十年，以其无子，故命汝为嗣，我死，汝子母切毋杀之。”（《契丹国志》卷七）皇后侍奉我四十年，因为没有孩子所以立你为嗣，我死了之后，你告诉你亲妈，就是元妃萧耨斤，千万别把皇后给害死。耶律宗真点头称是，儿臣领命，父皇放心地去吧。辽圣宗遗命，萧菩萨哥皇后上尊号齐天皇太后。圣宗归天后，耶律宗真继位，是为辽兴宗。

兴宗一继位，元妃大权在握，为了扳倒齐天皇太后，她就密谋要陷害萧菩萨哥。首先她把先皇的遗诏焚毁了，遗诏里说，皇后是太后，元妃是太妃，太妃也还是妃，所以这遗诏必须焚毁。元妃焚诏之后把自己抬升到太后的位置上，自称法天皇太后，等于现在是两宫太后了。这非常像清朝的慈安、慈禧，慈安是正宫，慈禧是生母，也是这样的两宫太后。她跟清朝的慈禧太后也有相似之处，就是一定要把正宫太后给扳倒。于是诬陷皇后的两个亲弟弟谋反，编排了一堆罪证，把两位国舅下狱处死。

两位国舅冤死之后，法天太后就要对齐天太后开刀了，原来的元妃要对原来的皇后开刀，报当年的一箭之仇，她要把太后下狱，兴宗皇帝赶紧出面阻止。《辽史后妃传圣宗仁德皇后萧氏》记载，兴宗说：“皇后侍先帝四十年，抚育眇躬，当为太后；今不果，反罪之，可乎？”你自称太后本来就不符合先帝遗诏，现在还要把齐天太后害死，能这么干吗？法天太后就教育自己的亲儿子，“此人若在，恐为后患”，必须杀掉。兴宗抗辩：“皇后无子而老，虽在，无能为也。”她无子年老，就养着她吧，不要杀害。兴宗这个时候虽然没有什么实权，但他毕竟是皇上，所以他说话，法天太后也不能不听。既然兴宗反对杀她，那行吧，就把她关起来。关起来之后，处心积虑地找机会要下手。终于趁兴宗一不留神的时候，法天太后派内侍传旨，让齐天太后自尽。齐天太后看到这个让她自尽的圣旨之后，对来人说，我实无罪，天下共知。然后沐浴，自缢而死，时年五十岁。

辽圣宗最珍爱的皇后，他立下遗诏要保全的皇后，终究还是没能保全。