故事发生在《星战前传:魅影危机》后的第10年,此时银河系正处于一片混乱和动荡之中。在变节的杜库伯爵(克里斯托弗·李)策动下,有几千个太阳星系决定一起脱离银河系共和国独立,然而银河系共和国还不具备足够的军事实力来镇压这些分离主义份子,在武力不足的状况下,银河系共和国联合议会决定组成临时军队攻打分离主义份子,而其中的一名议员,也就是纳波星球前任女王阿米达拉(娜塔莉·波特曼)却力排众议,极力反对这种以暴力对抗暴力的策略,因为这会引发银河系内大规模的争斗和屠戮,但并不是每个人都同意阿米达拉维护和平的决心,于是不断有人密谋刺杀阿米达拉,以达到自己不可告人的目的。